Chiesa di Santa Margherita in Trastevere, Chiesa parrocchiale rinascimentale nel Trastevere, Roma, Italia.

La chiesa di Santa Margherita in Trastevere si trova in piazza di Sant'Apollonia, nel rione Trastevere a Roma. La facciata è a due ordini ed è sovrastata da una croce con rami di palma; sulla fronte si legge la doppia dedica a Santa Margherita vergine e martire e a Sant'Emidio vescovo e martire. All'interno, un'unica navata con volta a botte e abside semicircolare si apre su tre cappelle laterali.

La chiesa fu commissionata nel 1680 dal Cardinale Girolamo Gastaldi e ricostruita dall'architetto Carlo Fontana, alterando l'orientamento originale che risaliva al 1288. Questa trasformazione rifletteva i movimenti di rinnovamento del periodo Barocco che hanno rimodellato molte strutture a Roma.

La pala dell'altare maggiore è la «Santa Margherita sconfigge il demonio» di Giacinto Brandi, dipinta nel 1680-1683 per la chiesa ricostruita; gli ovali ai lati sono di Giuseppe Ghezzi. Nella cappella di sinistra si trova l'«Immacolata fra san Francesco e santa Chiara» del Baciccia. La facciata riporta la doppia dedica a santa Margherita e a sant'Emidio vescovo e martire.

La chiesa si trova in piazza di Sant'Apollonia 13, a Trastevere, a pochi passi da viale di Trastevere. Il convento contiguo è stato trasformato in abitazioni civili, perciò l'ingresso della chiesa è l'unico accesso. Fino al 1996 vi officiava la Confraternita di Sant'Emidio; dal 2 febbraio 1997 la chiesa è affidata a un sacerdote del Vicariato di Roma.

La chiesa ebbe anche i nomi di Santa Margherita della Scala e di Santa Elisabetta; le religiose vi vivevano come bizzoche senza voto di clausura, come confermano gli atti di una visita fatta a Roma sotto Alessandro VII. Sulla facciata si legge la doppia dedica a santa Margherita e a sant'Emidio, vescovo e martire.